In dem Projekt “Entwicklung einer hybrid-parallelen Rechnerarchitektur für Bioinformatik” arbeitet der Lehrstuhl Technische Informatik der CAU Kiel mit der Johannes Gutenberg-Universität Mainz und der SciEngines GmbH aus Kiel zusammen.

Ziel des Projekts ist die Konzeption und Umsetzung einer neuartigen Rechnerarchitektur mit zugehörigen Softwaresystemen, mit der Probleme der Bioinformatik um Größenordnungen schneller und leistungseffizienter bearbeitet werden können als mit herkömmlichen Computern. Gleichzeitig soll die Lösung flexibel sein, um zukünftige Anforderungen und ein breites Feld von biologischen und medizinischen Anwendungen in verschiedenen Industrien bedienen zu können. Durch eine physische Kombination von FPGA- und GPU-basierter Hardware wird die Basis gelegt, um neue hybrid-parallele Algorithmen entwickeln zu können, die aus einem FPGA-Anteil und einem GPU-Anteil bestehen. Während die Entwicklung der Hardware in dem Projekt bei der Firma SciEngines angesiedelt ist, werden die Software-Systeme von den Universitäten Kiel und Mainz entwickelt.

Projektpartner:

Christian-Albrechts-Universität zu Kiel (Arbeitsgruppe Technische Informatik)